Ανακλήθηκε σήμερα από τους συγγραφείς του, μελέτη η οποία ισχυρίζεται ότι η παραλλαγή Omicron του SARS-CoV-2 προέκυψε σταδιακά, σε μια περιοχή της Αφρικής.
Στην ανακοίνωση της ανάκλησης, και οι 87 ερευνητές που συμμετείχαν στην εργασία, αναγνώρισαν ότι οι κρίσιμες αλληλουχίες γονιδιώματος -στων οποίων τα συμπεράσματα βασίστηκε η μελέτη- ήταν αποτέλεσμα μόλυνσης.
«Κάναμε ένα λάθος και αυτό είναι πικρό», λέει ο ανώτερος συγγραφέας Felix Drexler, του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου Charité στο Βερολίνο.
Τελικά από που προέρχεται η παραλλαγή Omicron- Τα σενάρια που εξετάζουν οι επιστήμονες
Η παραλλαγή Omicron ανακαλύφθηκε για πρώτη φορά στα τέλη του 2021 στη Μποτσουάνα και τη Νότια Αφρική, εξαπλώθηκε γρήγορα σε όλο τον κόσμο και έκτοτε κυριαρχεί στην πανδημία.
Η ακριβής προέλευσή της ήταν ένα μυστήριο, καθώς η Omicron δεν έμοιαζε με καμία από τις παραλλαγές που κυκλοφορούσαν πριν από το ξέσπασμα του κορονοϊού.
Οι ερευνητές έχουν παρουσιάσει διάφορες ιδέες για να εξηγήσουν το γενετικό χάσμα.
Σε ένα σενάριο, ο ιός πέρασε από μια εκτεταμένη περίοδο εξέλιξης σε ένα ζώο ξενιστή και στη συνέχεια χύθηκε πίσω στους ανθρώπους.
Σε μια άλλη, εξελίχθηκε σε μεγάλο χρονικό διάστημα σε έναν μόνο ασθενή με χρόνια λοίμωξη.
Μια τρίτη πιθανότητα ήταν ότι ο ιός κυκλοφορούσε αθόρυβα και μεταλλάσσονταν σε μια περιοχή του κόσμου όπου λίγοι ιοί συλλέγονταν και αλληλούχονταν.
Τι υποστήριζε η μελέτη και γιατί ανακλήθηκε
Η μελέτη που ανακλήθηκε φάνηκε να επιβεβαιώνει την τρίτη επιλογή. Με τον έλεγχο χιλιάδων παλαιότερων δειγμάτων από ασθενείς με COVID-19 από όλη την Αφρική με έναν ειδικό για την Omicron προσδιορισμό, οι ερευνητές βρήκαν στοιχεία της παραλλαγής σε 25 δείγματα ασθενών από την Ανατολική και Δυτική Αφρική ήδη από τον Αύγουστο και τον Σεπτέμβριο του 2021, μήνες πριν από την έκρηξη.
Οι ερευνητές ανέλυσαν την αλληλουχία των γονιδιωμάτων από πέντε από τα δείγματα, και διαπίστωσαν ότι είχαν ορισμένα χαρακτηριστικά του Delta - της προηγούμενης κυρίαρχης παραλλαγής - και μερικά του Omicron, υποδηλώνοντας ότι αντιπροσώπευαν ένα ενδιάμεσο στάδιο εξέλιξης.
Ο ερευνητής Kristian Andersen, ο οποίος μελετά την εξέλιξη των παθογόνων στο Scripps Research, λέει ότι η θεωρία της σταδιακής εξέλιξης ήταν ήδη «εκτός τραπεζιού» πριν από τη δημοσίευση της εργασίας.
«Εάν η Omicron είχε πραγματικά εξελιχθεί καθώς ο SARS-CoV-2 εξαπλώθηκε σταδιακά σε έναν πληθυσμό, θα έπρεπε να είχε πολλές περισσότερες συνώνυμες μεταλλάξεις, τον τύπο που δεν οδηγεί σε αλλαγές στις ιικές πρωτεΐνες, επειδή τέτοιες μεταλλάξεις συχνά «διορθώνονται». Γι’ αυτό, όταν βγήκε αυτή η μελέτη υπήρξαν έντονες αντιδράσεις», λέει ο Andersen.
Οι αστοχίες της μελέτης
Οι αλληλουχίες γονιδιώματος που παρουσιάστηκαν ως πρώιμοι πρόγονοι της Omicron είχαν πολλές μεταλλάξεις που αναμένονταν σε μια πρόδρομη ουσία, αλλά και μερικές που είναι τυπικές της υποπαραλλαγής BA.1 της Omicron, η οποία εξελίχθηκε αργότερα.
«Αυτό το μοτίβο υποδηλώνει ότι υπήρχε πρόβλημα μόλυνσης», λέει ο Michael Worobey, εξελικτικός βιολόγος στο Πανεπιστήμιο της Αριζόνα στο Tucson.
Οι ερευνητές αναγνώρισαν ότι τα δείγματα της επικείμενης μελέτης -αποσπάσματα γονιδιώματος που αναλύονται μεμονωμένα και στη συνέχεια συγκεντρώνονται- φάνηκαν να είναι αποτέλεσμα μόλυνσης.
Έτσι η ομάδα κατέληξε στο συμπέρασμα ότι είχε ουσιαστικά αλληλουχήσει κομμάτια της Omicron και προηγούμενων στελεχών SARS-CoV-2.
Στη συνέχεια, ο υπολογιστής τα έραψε σε μια αλληλουχία γονιδιώματος που μεταμφιέστηκε ως ιός στα μισά του δρόμου μεταξύ της Omicron και των προηγούμενων παραλλαγών.
Μια προσπάθεια αλληλουχίας των ιών ξανά από υπολειμματικά δείγματα δεν αναπαράγει τα προηγούμενα αποτελέσματα», υποστήριξε ο ανώτερος συγγραφέας της μελέτης Felix Drexler λέγοντας ότι, θα είχε αποφευχθεί η δημοσίευση και η ανάκληση της εργασίας. Δεν φάνηκε απαραίτητο να εκδοθούν βιαστικά οι πληροφορίες επειδή δεν απαντούσαν σε επείγοντα ερωτήματα δημόσιας υγείας, αλλά «μετανιώνω εκ των υστέρων για αυτό».
ΠΗΓΗ: science.org
