Πέρυσι ο παθολόγος Jeffrey SoRelle και οι συνεργάτες του προχώρησαν στην ανάπτυξη του CoVarScan, το οποίο στην ουσία πρόκειται για ένα rapid test ανίχνευσης της νόσου covid -19 το οποίο μπορούσε να ανιχνεύει 8 διαφορετικά στελέχη του ιού SARS-CoV-2.
Τώρα, αφού πλέον έχει χρησιμοποιηθεί σε πάνω από 4.000 ασθενείς που συλλέχθηκαν στο πανεπιστήμιο UT Southwestern, η ομάδα αναφέρει στο ακαδημαϊκό περιοδικό Clinical Chemistry ότι το τεστ αυτό είναι τόσο ακριβές όσο άλλες μέθοδοι που χρησιμοποιούνται για την διάγνωση της νόσου Covid -19 και μπορεί να ξεχωρίσει όλα τα γνωστά είδη παραλλαγών του ιού SARS-CoV-2.
«Χρησιμοποιώντας το τεστ αυτό μπορούμε να εντοπίσουμε πολύ γρήγορα ποιες παραλλαγές στην κοινότητα βρίσκονται σε έξαρση» δήλωσε ο καθηγητής SoRelle, βοηθός καθηγητή Παθολογίας και επικεφαλής της μελέτης. Ο ίδιος παράλληλα τόνισε ότι η εξέταση αυτή μπορεί να βοηθήσει τους ασθενείς να αντιμετωπίσουν καλύτερα τις μεταλλάξεις χορηγόντάς τους καλύτερες θεραπείες.
Επιπλέον, τα αποτελέσματα της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου UT Southwestern βοήθησαν τους υγειονομικούς να παρακολουθήσουν την διασπορά της νόσου COVID-19 στο Νότιο Τέξας και να διαμορφώσουν πολιτικές που βασίζονται στην επικράτηση των μεταλλάξεων. Οι γιατροί επίσης χρησιμοποίησαν τα αποτελέσματα αυτά για να επιλέξουν τα μονοκλωνικά αντισώματα, τα οποία είναι πιο αποτελεσματικά έναντι κάποιων στελεχών που μόλυναν πολύ βαριά κάποιους ασθενείς.
Τα άλλα τεστ για την ανίχνευση του covid -19 εντοπίζουν ένα μέρος του γενετικού υλικού του ιού SARS-CoV-2, ή μικρά μόρια που υπάρχουν στην επιφάνεια του ιού και δεν παρέχουν πληροφορίες για την ανίχνευση της παραλλαγής. Επιπλέον, αρκετοί ερευνητές ανησυχούν ότι οι εξετάσεις αυτές δεν είναι ακριβείς ως προς την ανίχνευση κάποιων παραλλαγών ή ότι μελλοντικά δεν θα μπορούν να εντοπίζουν άλλα στελέχη του ιού. Για να καθορίσουν ποια παραλλαγή του covid -19 μπορεί να έχει ένας ασθενής, οι επιστήμονες πρέπει να χρησιμοποιήσουν ολόκληρη την αλληλουχία του γονιδιώματος του ιού, γεγονός το οποίο είναι και χρονοβόρο και κοστίζει ακριβά, καθώς η εξέταση βασίζεται σε εξειδικευμένο εξοπλισμό και ανάλυση για να εξακριβώσουν την αλληλουχία RNA που περιέχεται στους ιούς.
Έτσι, στις αρχές του 2021, ο καθηγητής SoRelle και οι συνεργάτες του από τη Ιατρική Σχολή του πανεπιστημίου UT Southwestern θέλησαν να δουν πόσο ακριβή είναι τα τεστ που υπάρχουν τώρα όσον αφορά την ανίχνευση των παραλλαγών που υπάρχουν. Τότε συνειδητοποίησαν ότι αυτή η διαδικασία θα ήταν αρκετά χρονοβόρα και δαπανηρή και έτσι δημιούργησαν το δικό τους τεστ σε συνεργασία με το Κέντρο McDermott Next Generation Sequencing Core, θυγατρική της Eugene McDermott Center for Human Growth and Development, το οποίο και διευθύνει η Helen Hobbs, καθηγήτρια Εσωτερικής Ιατρικής και Μοριακής Γενετικής.
Το νέο rapid test αυτό βασίζεται στην μέθοδο PCR (Μοριακή Μέθοδος Ανάλυσης) που χρησιμοποιείται στα διαγνωστικά εργαστήρια. Σύμφωνα με όσα αναφέρει η ομάδα του SoRelle, η ομάδα εντόπισε πάνω από 4000 θετικά τεστ τα οποία και συνέλεξε από τον Απρίλιο του 2021 μέχρι τον Φεβρουάριο του 2022 και επρόκειτο τόσο για ασθενείς που δεν είχαν συμπτώματα όσο για ασθενείς που είχαν συμπτώματα. Τα τεστ αυτά επαληθεύτηκαν με τον παραδοσιακό τρόπο ανίχνευσης του γονιδιώματος του ιού και τα αποτελέσματα χρησιμοποιήθηκαν από γιατρούς ώστε να επιλέξουν την κατάλληλη θεραπεία για τους βαριά νοσούντες.
Σε σύγκριση με την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος, το CoVarScan είχε 96% ευαισθησία και 99% ακρίβεια. Μπορεί να ανιχνεύει στην Δέλτα, την Mu, την Λάμδα και την Ομικρον και τις υποπαραλλαγές της, ακόμα και την «αόρατη» παραλλαγή της την BA.2, για την οποία τα άλλα τεστ δεν έχουν την ικανότητα εντοπισμού της.
Πηγή: https://medicalxpress.com
